La terza stagione pone le basi per i grandi cambiamenti che avverrano nel ciclo successivo.
Uno dei momenti che tutti i telespettatori aspettavano, il temuto incontro con i Borg, sta per diventare realtà e si arricchisce dell'introduzione di una nuova, micidiale razza aliena. Tanto micidiale da essere addirittura in grado di causare serissimi problemi agli stessi Borg.
Mentre scopriamo nuovi lati della personalità del capitano (Sacred Ground), assistiamo allo spassoso ritorno di Q (Questioni di Q-ore), apprezziamo le doti recitative di Jennifer Lien, alias Kes (Warlord) e veniamo rapiti dagli eventi - destinati a cambiare molte cose a bordo della Voyager, in particolare il ruolo del Dottore - del doppio episodio Future's End.
Con una serie di episodi di alto livello, cast e autori ci portano per mano fino alla conclusione: la prima parte di Scorpion, forse il miglior episodio di tutta la storia di Voyager, pronto a scioccare il pubblico e a lasciarlo con il fiato sospeso fino alla stagione successiva…

Gli episodi
1. Sopravvivenza – parte 2 (Basics – part 2)
2. Flashback (Id.)
3. La prigione (The Chute)
4. Lo sciame (The Swarm)
5. Profeti e perdite (False Profits)
6. Un sogno da ricordare (Remember)
7. Terra sacra (Sacred Ground)
8. Futuro anteriore – parte 1 (Future’s End – part 1)
9. Futuro anteriore – parte 2 (Future’s End – part 2)
10. Il signore della guerra (Warlord)
11. Questioni di Q-ore (The Q and the Grey)
12. Il virus (Macrocosm)
13. Il prezzo dell’onestà (Fair Trade)
14. Un amore impossibile (Alter Ego)
15. Circolo chiuso (Coda)
16. La febbre del sangue (Blood Fever)
17. Unito (Unity)
18. Il lato oscuro (The Darkling)
19. L’ascesa (Rise)
20. Il gioco della mantide (Favorite Son)
21. Prima e dopo (Before and After)
22. Problemi di famiglia (Real Life)
23. L’origine della specie (Distant Origin)
24. Lo zoo (Displaced)
25. La peggiore delle ipotesi (Worst Case Scenario)
26. Il patto dello scorpione – parte 1 (Scorpion – part 1)
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